甲状腺、乳腺，肝胆、胰腺、胃肠、急腹证，腹壁疝、皮肤及软组织感染的中西医结合治疗。各种疑难杂病的中医治疗。

近两年，医院共获得科研项目立项105项，其中国家自然科学基金22项，其它国家级重大项目3项，自治区级项目54项。获得新疆医学科技奖一等奖1项，二等奖3项，三等奖6项，自治区科技进步奖三等奖2项;第十届自治区自然科学优秀论文二等奖 1项;乌鲁木齐市科学技术进步奖三等奖1项;通过自治区科技成果鉴定4项;获得国家新药临床试验批件2项。,医院拥有CT、磁共振、血管机等高、精、尖设备及达到国际标准的百级净化手术室、数字减影室、重症监护室、高压氧舱、卒中病房等设施，开展了介入治疗、心脏搭桥手术、心脏、肝脏、肾脏等器官移植技术、人工关节置换手术、脊柱外科手术及胸腔镜手术、关节镜手术等多学科腔镜手术，部分技术处于疆内领先水平。