各种肾脏病和风湿病的诊断及治疗，难治性肾病的中西医结合治疗、慢性肾功能衰竭一体化治疗、以及系统性红斑狼疮及狼疮性肾炎、类风湿性关节炎、糖尿病肾病等疾病的诊治甲状腺、胃肠道疾病及普通外科常见疾病的诊治肝、胆、胰疾病，腹腔镜胆囊切除术，消化道肿瘤、甲状腺疾病的诊治。

近来年，医院先后获科技成果奖19项，其中获省部级二等奖以上、国家三等奖以上成果奖19项，发表学术论文1500余篇，承办国际、全国及全军大型学术会议80多次。2002年及2003年连续两年获四川省科技进步一等奖。,医院引进和购置了多种现代化的诊疗设备，如PET/CT、核磁共振成象仪、螺旋CT、直线加速器、头部及体部X一刀、1250MAX光机、前列腺射频治疗仪、血细胞分离机及多种型号的B超声仪，设备总价值为1亿5千余万元，为临床的诊治和治疗提供了先进的硬件保障。